W 2009 powrócił do MSZ, najpierw do Departamentu Wschodniego, a następnie Biura Dyrektora Politycznego jako zastępca dyrektora oraz korespondent europejski w trakcie polskiej prezydencji w Radzie Unii Europejskiej. W 2013 Bobak wyjechał do ambasady w Tel Awiwie, gdzie zajmował się promocją współpracy naukowo-technologicznej, akademickiej, kwestiami innowacyjności, turystyki. W 2017 powrócił do Warszawy. Po kilku miesiącach pracy jako I radca w Departamencie Współpracy Ekonomicznej MSZ, w lutym 2018 objął stanowisko dyrektora Departamentu Afryki i Bliskiego Wschodu.
26 lipca 2020 został odwołany ze stanowiska dyrektora i otrzymał nominację na stanowisko Ambasadora RP w EtiopiiPostanowienie Prezydenta Rzeczypospolitej Polskiej z dnia 21 lipca 2020 r. nr 110.23.2020 w sprawie mianowania Ambasadora Rzeczypospolitej Polskiej (). z jednoczesną akredytacją w DżibutiPostanowienie Prezydenta Rzeczypospolitej Polskiej z dnia 21 lipca 2020 r. nr 110.25.2020 w sprawie mianowania Ambasadora Rzeczypospolitej Polskiej ()., Sudanie PołudniowymPostanowienie Prezydenta Rzeczypospolitej Polskiej z dnia 15 października 2020 r. nr 110.43.2020 w sprawie mianowania Ambasadora Rzeczypospolitej Polskiej ()., przy Unii Afrykańskiej, IGAD i UNECAPostanowienie Prezydenta Rzeczypospolitej Polskiej z dnia 21 lipca 2020 r.