Własne filtry uBlock Origin umożliwia tworzenie dodatkowych filtrów („Moje filtry”) ze składnią podobną do AdGuard i Adblock Plus. Reguły umożliwiają zarówno blokowanie konkretnych adresów URL według ich początku lub wyrażeń regularnych.
Dostępne są dwa rodzaje reguł (filtrów):
blokujące – domyślny rodzaj reguł; akceptujące (biała lista) – reguły zaczynające się od @@, z pozostałą składnią analogiczną jak te blokujące.
Filtry akceptujące zazwyczaj nadpisują filtry blokujące (chyba że filtr blokujący ma opcję important). Inne opcje podane w danym filtrze umożliwiają m.in. blokowanie żądań według typu zasobów (np. image do blokowania obrazków, script do blokowania JavaScript itp.), ale również określenie, czy filtr ma dotyczyć tylko żądań wykonywanych do wpisanego URL z konkretnej domeny, czy inne warunki tego typu. Dostępne są również tzw. filtry kosmetyczne, umożliwiające ukrywanie konkretnych elementów HTML.
Listy filtrów uBO używa gotowych zbiorów filtrów różnego rodzaju. Sama społeczność związana z uBlock tworzy filtry do blokowania niechcianych reklam, złośliwego oprogramowania, witryn i skryptów naruszających prywatność oraz zbiór filtrów poprawkowych.