Jednostka weszła do składu 13 Dywizjonu Trałowców 8 Flotylli Obrony Wybrzeża w Świnoujściu (początkowo należącego do 9 Flotylli Obrony Wybrzeża).
W 1998 roku jednostka wraz z załogą wzięła udział w ćwiczeniach REKIN 98 na wodach Południowego Bałtyku. 21 grudnia tego samego roku „Mamry” uczestniczył w poszukiwaniach a następnie podjęciu z wody w pobliżu Łeby ćwiczebnej miny morskiej, której wykrycie poprzedniego dnia zgłosił kuter rybacki DAR-25. W dniach 7-16 czerwca 1999 okręt uczestniczył w manewrach BALTOPS 99, wraz z okrętami OORP „Resko”, „Sarbsko”, „Drużno”, „Wigry” oraz „Śniardwy” na wodach Morza Bałtyckiego.
10 lutego 2000 roku okręt brał udział w obchodach 80 rocznicy zaślubin Polski z morzem, wraz z ORP „Darłowo”.
W dniach 6-09 listopada 2007 roku ORP „Mamry” uczestniczył w manewrach MCM SQNEX, wraz z OORP „Mewa”, „Gopło” i „Flaming” oraz ćwiczył z zespołem NATO w rejonie Zatoki Gdańskiej.