3.
W roku 1956 funkcję dyrektora objął Stanisław Kołpacki. Wówczas do klas licealnych do szkoły dołączyły 3 oddziały szkoły podstawowej (klasy od 5–7), realizując ówczesną koncepcję szkoły jedenastoletniej – podstawówka miała 7 klas i klasy liczone były w jednym ciągu – od pierwszej do jedenastej.
Z okazji 20. rocznicy utworzenia tej placówki edukacyjnej szkole nadano imię oraz sztandar. Na patrona szkoły wybrano kompozytora urodzonego na Warmii, autora muzyki do „Roty” i znanego propagatora polskości – Feliksa Nowowiejskiego. 20 kwietnia 1966 roku Kuratorium Okręgu Szkolnego w Olsztynie zatwierdziło nazwę szkoły w brzmieniu: Liceum Ogólnokształcące im. Feliksa Nowowiejskiego w Braniewie, która obowiązuje do dziś.
Na skutek reformy nauczania, wprowadzonej Ustawą z dnia 15 lipca 1961 roku o rozwoju systemu oświaty i wychowania, i przedłużenia nauki z siedmiu do ośmiu lat, w roku szkolnym 1969/70 w liceum nie było klasy maturalnej. W tym roku nie odbyły się też egzaminy dojrzałości.
W związku z reformą administracyjną w 1975 roku, wprowadzającą nowy podział na województwa, od roku szkolnego 1975/76 szkołę podporządkowano Kuratorium Oświaty i Wychowania w Elblągu.