Misja i specyfika Kolegium za swój główny cel uznaje intelektualna formację kandydatów do kapłaństwa. Cel ten jest realizowany na drodze studiów filozoficzno-teologicznych, wraz z przygotowaniem katechetyczno-pedagogicznym. Studia w Kolegium cechują się szczególną wiernością wobec myśli św. Tomasza z Akwinu, zachowując otwartość i szacunek wobec innych tradycji teologicznych. Specyfiką dominikańskiego studium jest przywiązywanie wielkiej wagi do filozofii oraz do teologii dogmatycznej, co znajduje swój wyraz w poszerzonym programie nauczania tych dziedzin.
Program studiowania oraz sposób funkcjonowania Kolegium są określone przez Statut Kolegium Filozoficzno-Teologicznego Polskiej Prowincji Dominikanów, stanowiący część Ratio Studiorum Particularis Provinciæ Poloniæ, zatwierdzonego przez generała Zakonu, br. Gerarda Francisco Timonera III OP dnia 7 lipca 2022 roku. Powyższy program studiów oraz zasady funkcjonowania Kolegium pozostają zgodne z dominikańskim Ratio Studiorum Generalis oraz z powszechnym prawem Kościoła, w szczególności z konstytucją apostolską papieża Franciszka Veritatis gaudium.