Wydarzenia te odbiły się szerokim echem w Europie.

W 1728 roku jezuici otworzyli katedrę prawa kanonicznego, natomiast w 1730 rektor kolegium jezuickiego w Toruniu Franciszek Błociszewski otworzył katedrę fizyki i metafizyki.

W pierwszej połowie XVIII wieku w szkole jezuickiej w Toruniu założona została przez biskupa chełmińskiego Teodora Potockiego katedra teologii.

W okresie wojny siedmioletniej Toruń stał się zapleczem wojsk rosyjskich walczących przeciw Prusakom. W 1758 roku generał nakazał wycinać lasy w okolicach Torunia Do wyciętych drzew należały również dęby jezuitów toruńskich. Natomiast w folwarku jezuickim w wyniku zarazy przyniesionej przez żołnierzy moskiewskich zmarło 12 ludzi.

W 1767 roku w Toruniu została zawiązana konfederacja szlachty dysydenckiej. Reakcją na zawiązanie tej konfederacji było powstanie konfederacji radomskiej.

W 1767 roku burmistrz Torunia fałszywie oskarżył przed królem studentów o udział w bójce między żołnierzami a flisakami, w której z rąk żołnierzy zginęło dwóch flisaków. Król nakazał rektorowi kolegium jezuickiego wszczęcie śledztwa w tej sprawie grożąc, że w razie nie wykrycia sprawców sprawą zajmie się sąd królewski.