William Gilson Farlow (ur. 17 grudnia 1844 w Bostonie, zm. 3 czerwca 1919 w Cambridge) – amerykański botanik i mykolog.
Życiorys William Gilson Farlow w 1866 r. ukończył studia na Uniwersytecie Harvarda. Rok później wstąpił do Harvard Medical School. W 1870 r. uzyskał tytuł magistra i został asystentem profesora Asy Greya na katedrze historii naturalnej. W 1872 roku, chcąc zdobyć większą wiedzę botaniczną, udał się do Europy, gdzie przez dwa lata studiował u Antona de Bary i innych wybitnych botaników w Niemczech, Francji i Skandynawii. Po powrocie został mianowany adiunktem botaniki w Bussey Institution na Jamaica Plains. W 1879 roku został mianowany profesorem botaniki kryptogamicznej (dział botaniki zajmujący się roślinami zarodnikowymi) na Uniwersytecie Harvarda. Na tym stanowisku pozostał do przejścia na emeryturę w 1896 r.
W 1900 r. Farlow poślubił Lillian Horsford, a ich dom stał się domem spotkań botaników. Farlow prowadził też obszerną korespondencję. Wśród wyróżnień, jakie uzyskał Farlow, były honorowe stopnie naukowe z Uniwersytetu Harvarda, Uniwersytetu Wisconsin, Uniwersytetu w Glasgow i Uniwersytetu w Uppsali.