W Urzykistanie zawiązały się dwie organizacje zwalczające najeźdźców: anarchistyczne ugrupowanie Al-Katala, które używa terroryzmu do wywołania konfliktu pomiędzy USA i Rosją oraz Siły Wyzwolenia Urzykistanu, które w konwencjonalny sposób zwalczają zarówno Rosjan, jak i Al-Katalę.
Przez większość czasu gracz wciela się w Amerykanina Alexa, który jest agentem CIA. W 2019 roku zostaje on wysłany na misję do Werdańska w Kastowii (fikcyjne lokacje leżące niedaleko Urzykistanu) w celu zinfiltrowania bazy najemników generała Barkowa oraz wykradnięcia stamtąd ładunku gazu bojowego. W trakcie trwania operacji bazę zaatakowała Al-Katala i wykradła gaz, co znacznie pogorszyło stosunki rosyjsko-amerykańskie.
W tym momencie rozgrywka przenosi się do Londynu, gdzie grupa agentów Special Air Service pod dowództwem sierżanta Kyle’a Garricka próbuje powstrzymać zamachowców z Al-Katali, którzy zamierzają przeprowadzić zamach bombowy na Piccadilly Circus. Zadanie się nie powodzi, bomba wybucha, a terroryści zaczynają strzelać do cywili i policjantów. Z pomocą Brytyjczykom przychodzi doświadczony agent John Price, dzięki któremu udaje się powstrzymać terrorystów.