Budynek ponownie popadł w zapomnienie, stając się wpierw obiektem wandalizmu, a następnie miejscem składu odpadów i śmieci z katedry.
Odrestaurowanie Dokładnie 16 sierpnia 1973 grupa seminarzystów i ministrantów z katedry, razem z ks. Tonym Merciecą zaczęła usuwać śmieci i sprzątać budynek kościoła, aby można było rozpocząć jego odnawianie. Ich przykład podziałał na ludzi, pomoc w postaci wyposażenia nadeszła też z innych kościołów. Artysta Toni Camilleri wykonał nowy ołtarz, wzorując się na starym, Ċensu Cordina namalował nowy obraz tytularny, gdyż oryginalny został wzięty do muzeum w celu konserwacji, i tam już pozostał.left|thumb|180px|Kościół św. Józefa (z lampą na rogu) oraz pałac Cagliaresa (w głębi)Niecałe dwa lata później, 19 marca 1975 odrestaurowany kościół został otwarty i pobłogosławiony przez ks. Ġużeppe Salibę. Papież Paweł VI przesłał specjalne błogosławieństwo dla osób zaangażowanych w przywrócenie świątyni do świetności. 15 sierpnia 1976 biskup Gozo Nikol Cauchi uroczyście poświęcił odnowiony kościół.