Historia W 2007 roku Centrum Historii i Nowych Mediów Roya Rosenzweiga (ang. Roy Rosenzweig Center for History and New Media – RRCHNM) po raz pierwszy wystąpiło o dofinansowanie rozwoju Omeki. Większość muzeów posiadała strony internetowe, ale instytucjom różnej wielkości brakowało zawartości o bardziej szczegółowych informacjach. Koordynatorzy stron wystaw muzealnych nie miały możliwości dodawania podstron; mieli również problem z samym udostępnianiem zawartości. Uznano, że publikowanie dostępnych kolekcji i wystaw ze standardem metadanych, można by osiągnąć poprzez zbudowanie darmowej, otwartej platformy, która, podobnie jak oprogramowanie do blogowania, oferowałaby łatwy w użyciu interfejs administracyjny, zapewniałaby udostępnianie treści, rozszerzałaby podstawowe funkcje publikowania kolekcji i archiwów o elastyczną architekturę wtyczek i bogate API tematyczne.
Omeka została uruchomiona w lutym 2008 roku i stała się wiodącą platformą publikacji internetowych typu open source dla kolekcji cyfrowych. Początkowo finansowana przez Instytut Usług Muzealnych i Bibliotecznych (ang. Institute Museum Library Services) w latach 2007–2010, była skierowana do małych muzeów i towarzystw historycznych.