Organy W kościele znajdują się 17-głosowe organy pneumatyczne, zbudowane w 1997 r. przez wrocławskiego organmistrza Antoniego Szydłowskiego. Wykorzystują one oryginalny prospekt z pierwotnego instrumentu, będącego dziełem Josepha Eberhardta ze Zgorzelca z lat 1750–1752.
Dyspozycja instrumentu Manuał IManuał IIPedał1. Pryncypał 8'1. Burdon 8'1. Subbas 16'2. Gamba 8'2. Pryncypał 4'2. Oktawbas 8'3. Flet podwójny 8'3. Flet drewniany 4'3. Chorałbas 4'4. Oktawa 4'4. Superoktawa 2'5. Flet otwarty 4'5. Kwinta 1 1/3'6. Kwinta 2 2/3'6. Cymbał 3×7. Piccolo 2'8. Mixtura 4×
Dzwony Pierwsza wzmianka o dzwonach w tym kościele pochodzi z 1695 roku, kiedy to kościół św. Antoniego otrzymał dwa dzwony odlane przez Siegmunda Götza. W 1917 roku zostały one zarekwirowane i przetopione na amunicję. W 1925 roku w wieży pojawiły się dwa nowe, lecz mniej okazałe dzwony, które nie przetrwały II wojny światowej. Obecnie kościół św. Antoniego posiada trzy dzwony.