W 1991 roku klub US La Malcontenta, który akurat zdobył awans z Promozione Veneto do Eccellenza Veneto (D6), przyjął nazwę US Malcontenta-Mestrina. W 1993 klub zmienił nazwę na Mestre Calcio. W 1995 zespół awansował do Campionato Nazionale Dilettanti, a w 1996 do Serie C2. Po zakończeniu sezonu 2002/03 klub został zdegradowany do Serie D, ale potem ogłosił upadłość z powodu trudności finansowych.
W 2003 klub został reaktywowany z nazwą AS Mestre i startował w rozgrywkach Terza Categoria Veneto (D10). W 2004 otrzymał promocję do Seconda Categoria Veneto, zmieniając nazwę na AC Mestre ASD. W 2005 zdobył awans do Prima Categoria Veneto, ale po fuzji z AC Martellago z nazwą AC Mestre awansował do ligi wspólnika – Promozione Veneto (D7). w 2007 spadł na rok do Prima Categoria Veneto. W 2010 ponownie spadł do Prima Categoria Veneto. W 2015 został promowany do Promozione Veneto, ale następnie przeprowadzono kilka reorganizacji. Klub z Mestre przeniósł się do Spinea i zmienił nazwę na ASD FC Spinea 1966; w tym samym czasie FC Union Pro przeniósł swoją siedzibę do Mestre i zmienił nazwę na SSD AC Mestre;