Po zakończeniu sezonu 1931/32 klub dobrowolnie zrezygnował z występów w trzeciej lidze i następny sezon rozpoczął w Terza Divisione Pugliese (D5), w której grał do 1935, a potem z przyczyn dyscyplinarnych został zawieszony kilka lat.
W 1938 roku klub odrodził się jako SS Trani i startował w Prima Divisione Puglia (D4). W 1940 zespół awansował do Serie C. W trzeciej lidze występował do 1943 roku, aż do rozpoczęcia na terenie Włoch działań wojennych II wojny światowej, wskutek czego mistrzostwa 1943/44 zostały odwołane.
Po zakończeniu II wojny światowej, klub wznowił działalność w 1945 roku i został zakwalifikowany do Serie C Centro-Sud. W 1947 został zdegradowany do Prima Divisione Puglia, która w 1948 roku w wyniku reorganizacji systemu lig została zdegradowana do piątego poziomu. W 1949 roku zmienił nazwę na AP Trani. W 1950 awansował do Promozione Puglia, która 1952 została przemianowana na IV Serie. Po zakończeniu sezonu 1956/57 klub został zdeklasowany do Campionato Interregionale - Seconda Categoria. W 1959 został promowany do Serie D. W 1962 otrzymał promocję do Serie C. W 1964 awansował do Serie B. W sezonie 1964/65 zajął 15.miejsce, a w następnym sezonie 20.miejsce w Serie B i spadł z powrotem do Serie C. W 1968 został zdegradowany do Serie D, a w 1971 awansował na rok do Serie C.