Rektorzy Akademii i Uniwersytetu Wileńskiego Towarzystwa Jezusowego – rektorzy Akademii i Uniwersytetu Wileńskiego Towarzystwa Jezusowego mianowani byli na 3 lata przez generała lub prowincjała jezuitów.

Piotr Skarga (1579-1581) Jakub Wujek (1581-1584) Paweł Boksza (1584-1586) Garzias Allabianus (1587-1590) Fryderyk Bartsch (1590-1596) Leonard Kraker (1597-1600) Paweł Boksza (1600-1603) Adam Brok (1603-1606) Michał Ortiz (1606-1608) Stanisław Włoszek (1608-1611) Szymon Niklewicz (1611-1614) Mikołaj Salpa (1614) Jan Grużewski (1615-1619) Szymon Niklewicz (1619-1621) Jan Grużewski (1625-1628) Szymon Ugniewski (1628-1632) Filip Frizius (1632-1635) Melchior Schmelling (1643-1644) Grzegorz Hintz (1644-1647) Benedykt de Soxo (1647-1650) Jan Wiskowiec Wojciech Cieciszewski Grzegorz Schönoff (1653) Jan Rywocki Wojciech Wijuk Kojałowicz (1654-1655) Benedykt de Soxo (1656-1658) Kazimierz Wijuk Kojałowicz Jan Piwocki Michał Ginkiewicz (1660-1663) Daniel Butwiłł (1663-1666) Andrzej Wołłowicz (1666-1669) Stanisław Tupik (1669-1672) Baltazar Rogalski (1672-1675) Paweł Bochen (1675-1678) Andrzej Rybski (1678-1681) Władysław Rudziński (1681-1683) Michał Mazowiecki (1683-1684) Piotr Kitnowski (1684-1688) Baltazar Dankwart (1694-1697) Krzysztof Łosiewski (1697-1701) Andrzej Rybski (1698) Jakub