W związku z ubieganiem się Cezarego Kuleszy o stanowisko prezesa PZPN-u zrezygnował on z funkcji prezesa klubu, na jego miejsce zarząd klubu dnia 15 lipca 2021 r. wybrał Agnieszkę Syczewską. Z dniem 1 lutego 2022 funkcję Prezesa Zarządu objął Wojciech Pertkiewicz. Zmiany w zarządzie i sztabie szkoleniowym: nowym dyrektorem ds. marketingu został Adrian Molski-Strzałkowski, nowym dyrektorem sportowym Jagiellonii Białystok został Łukasz Masłowski. Podczas ostatniego Walnego Zgromadzenia Spółki Jagiellonia Białystok S.S.A. podjęto decyzje o podwyższeniu kapitału zakładowego spółki oraz powołano na członka rady nadzorczej Pana Roberta Skrzypkowskiego. Drużynę opuścił dotychczasowy trener przygotowania motorycznego Dawid Musiał i asystent trenera Adrian Siemieniec. Piotr Grzybko będzie pełnił funkcję trenera bramkarzy akademii. Do sztabu szkoleniowego dołączyli asystent trenera – Marek Wasiluk, trener bramkarzy – Andrzej Olszewski oraz trener przygotowania fizycznego Michał Adamczewski.