Na skutek popierania prodemokratycznej opozycji i równoczesnej krytyki władz komunistycznych gazeta była przez wiele lat szykanowana przez reżim chiński. Po uchwaleniu kontrowersyjnej ustawy o bezpieczeństwie narodowym w Hongkongu, 10 sierpnia 2020 r. aresztowano m.in. założyciela „Apple Daily”, Jimmy’ego Laia, a siedziba główna gazety i powiązanych redakcji stała się celem nalotu policji (tzw. nalot na Next Digital), powszechnie potępianego w mediach międzynarodowych i przez organizacje obrony wolności praw człowieka i słowa (m.in. Amnesty International). Kolejny nalot policyjny na siedzibę „Apple Daily” miał miejsce 17 czerwca 2021 r., zamrożono wtedy też konta wydawcy, co grozi zamknięciem czasopisma z powodu natychmiastowej niewypłacalności. Władze chińskie oskarżają gazetę m.in. o „zmowę z obcymi siłami”. Naloty zostały skrytykowane przez przedstawicieli USA, Wielkiej Brytanii i Unii Europejskiej. Miesiąc wcześniej Jimmy Lai, w grudniu 2020 r. skazany na cztery miesiące więzienia, został skazany na kolejne czternaście, m.in. za „organizowanie nielegalnych protestów”.