Pięciokrotnie brał udział w zawodach o nazwie Race of Champions, wygrywając je w 1998 roku. W 1999 r. McRae przeszedł do zespołu Forda, a w 2003 r. dołączył do ekipy Citroëna. W 2004 roku wystąpił w wyścigu 24h Le Mans. W latach 2004 i 2005 brał udział w Rajdzie Dakar. W sezonie 2005 wrócił na dwa rajdy do mistrzostw świata. W rajdach Walii (7. miejsce) i Australii startował dla zespołu Škody. W sezonie 2006 podczas Rajdu Turcji zastąpił kontuzjowanego Sébastiena Loeba w Citroënie Xsara WRC z nr 1. McRae nie ukończył jednak tego rajdu; zrezygnował z powodu awarii na 18. odcinku specjalnym.
W latach 2006 i 2007 brał udział jako kierowca rajdowy w X Games (Igrzyska Sportów Ekstremalnych) w Stanach Zjednoczonych.
15 września 2007 r. Colin McRae zginął w katastrofie pilotowanego przez siebie śmigłowca Eurocopter AS 350 B2 Écureuil. Pozostałe trzy ofiary to pasażerowie maszyny: 5-letni syn Colina, Johnny Gavin McRae, 6-letni kolega Johnny’ego, Ben Porcelli, oraz przyjaciel rodziny, Graeme Duncan.