w skład Centrali i oddziałów wchodziły następujące działy i samodzielne stanowiska pracy: Dział Administracyjno-Gospodarczy; Dział Ekonomiki i Zarządzania Gospodarstwem; Dział Innowacji w Rolnictwie; Dział Finansowo-Księgowy; Dział Krajowej Sieci Obszarów Wiejskich; Dział Metodyki Doradztwa i Doskonalenia Zawodowego; Dział Organizacyjny; Dział Promocji i Wydawnictw; Dział Rolnictwa Ekologicznego i Działań Rolno-Środowiskowo-Klimatycznych; Dział Rozwoju Obszarów Wiejskich; Dział Systemów i Technologii w Rolnictwie; Dział Zastosowań Teleinformatyki.
Zadania Centrum Doradztwa Rolniczego Według obwieszczenia Marszałka Sejmu RP z 2023Obwieszczenie Marszałka Sejmu Rzeczypospolitej Polskiej z dnia 16 czerwca 2023 r. w sprawie ogłoszenia jednolitego tekstu ustawy o jednostkach doradztwa rolniczego () Centrum Doradztwa Rolniczego wykonuje następujące zadania z zakresu doradztwa rolniczego: przygotowuje i wprowadza jednolite sposoby działania ośrodków wojewódzkich w zakresie realizowanych przez nie zadań; przygotowuje i przekazuje ośrodkom wojewódzkim materiały informacyjne i szkoleniowe, w tym dotyczące pomocy w zakresie działalności gospodarstw rolnych i produkcji rolniczej finansowanej lub współfinansowanej ze środków pochodzących z funduszy Unii Europejskiej lub innych instytucji krajowych lub zagranicznych;