Lekkoatletyka na Igrzyskach Afrykańskich w 1999 – zawody lekkoatletyczne, które były rozgrywane w Johannesburgu (RPA).
Rozegrano 23 konkurencje męskie i 22 kobiece. Kobiety po raz pierwszy rywalizowały w skoku o tyczce i w rzucie młotem, a także w chodzie na 10 kilometrów zamiast chodu na 5000 metrów.
Rezultaty Mężczyźni Konkurencja16px|Złoto 1. miejsceWynik16px|Srebro 2. miejsceWynik16px|Brąz 3. miejsceWynikBieg na 100 m Leonard Myles-Mills 9,99 Francis Obikwelu 10,01 Frankie Fredericks 10,10Bieg na 200 m Francis Obikwelu 20,06 Joseph Batangdon 20,37 Daniel Effiong 20,49Bieg na 400 m Kennedy Ochieng 44,77 Clement Chukwu 45,31 Phillip Mukomana 45,43Bieg na 800 m Japheth Kimutai 1:44,91 Djabir Saïd-Guerni 1:45,32 Hezekiél Sepeng 1:45,58Bieg na 1500 m Hailu Mekonnen 3:39,73 David Lelei 3:40,46 Fred Cheruiyot 3:41,21Bieg na 5000 m Julius Gitahi 13:49,06 Fita Bayisa 13:49,79 Tom Nyariki 13:50,40Bieg na 10 000 m Assefa Mezgebu 28:12,15 David Chelule 28:13,71 Habte Jifar 28:15,11Maraton Joshua Peterson 2:19:07 Focus Wolbroad 2:20:47 Frank Pooe 2:23:36Bieg na 110 m przez płotki William Erese 13,71 Joseph-Berlioz Randriamihaja 13,85 Kehinde Aladefa 13,86Bieg na 400 m przez płotki Ibou Faye 48,30 Ken Harnden 48,47 Erick Keter 49,17Bieg na 3000 m z przeszkodami Kipkurui Misoi 8:32,42 Wilson Boit Kipketer 8:41,33 Christopher Koskei