W roku 1721 przy kolegium powstała apteka, pierwotnie była ona umiejscowiona w budynku rezydencji. W roku 1738 została przeniesiona do południowego skrzydła kolegium. Uległa zniszczeniu w pożarze z roku 1751. Nie udało jej się ostatecznie w całości odbudować. W 1774 roku po kasacie wydzierżawiona została przez chirurga związanego z Radziwiłłami Fryderyka Teodora Oehme. W 1836 roku znajdowała się w posiadaniu jego potomków. Apteka posiadała księgozbiór liczący 28 pozycji. O ile 24 z nich były książkami medycznymi, to pozostałe cztery miały charakter religijny i służyły przygotowaniu chorych do śmierciTamże, s. XLII-XLIII..
Biblioteka
Biblioteka powstała wraz z rozpoczęciem działalności placówki. Również uległa pożarowi z roku 1751. Jezuici szybko przystąpili do odnowienia księgozbioru poprzez zakupy i donacje. W roku 1773 biblioteka liczyła 1006 pozycji. Księgozbiór po kasacie zostały przejęte przez KEN. W roku 1797 księgozbiór został przekazany do klasztoru dominikanów. W roku 1804 dominikanie łącznie posiadali około 2000 pozycji, natomiast w roku 1812 po utworzeniu lazaretu wojskowego księgozbiór liczył już tylko 600 ksiąg. W roku 1857 po zamknięciu klasztoru woluminy rozeszły sięTamże, s. XLIII-XLIV..