Poza tymi elementami – Atos Prime II był zupełnie nową konstrukcją, z innymi wymiarami zewnętrznymi i zaprojektowaną na nowo stylizacją nadwozia z charakterystycznymi, dużymi reflektorami. Głównym celem konstruktorów było zapewnienie ogólnej, lepszej jakości wykonania i bogatszego wyposażenia standardowego. Wprowadzono także nową, mocniejszą jednostkę napędową o pojemności 1,1-litra, która zapewniała lepszą dynamikę i elastyczność.
Sprzedaż Atos Prime II ponownie był samochodem przeznaczonym do sprzedaży na rynkach globalnych. Spośród rynków europejskich producent kontynuował odrębną politykę nazewniczą wobec Wielkiej Brytanii, gdzie podobnie jak dotychczas samochód nosił nazwę Hyundai Amica.
Z Indiach z racji pozostania w produkcji starszego odpowiednika, odnowiony model otrzymał dłuższą nazwę, Hyundai Santro Xing. Podobnie jak poprzednik, także i nowszy Atos Prime był sprzedawany w Meksyku jako Dodge Atos w ramach sieci dealerskiej Dodge.
Koniec produkcji i następca W 2008 roku produkcja i sprzedaż Atosa Prime zakończyła się m.in. w Europie i Meksyku na rzecz zupełnie nowego modelu, Hyundai i10.