Struktura ACKS tworzą dwa ośrodki: Ośrodek Analiz i Doktryn oraz Ośrodek Szkolenia: Ośrodek Analiz i Doktryn ACKS zajmuje się monitorowaniem i analizą pojawiających się tendencji w środowisku informacyjnym, na podstawie których opracowuje raporty, ekspertyzy, opinie i publikacje dotyczące komunikacji strategicznej w Polsce i NATO. Uczestniczy również w badaniach naukowych w ww. obszarach oraz pracach nad nowoczesnymi technologiami informatycznymi, zagrożeniami hybrydowymi i ich wpływem na bezpieczeństwo narodowe Polski. We współpracy z Centrum Doktryn i Szkolenia SZ RP opracowuje i aktualizuje doktryny dotyczące komunikacji strategicznej oraz przepisy dotyczące polityki informacyjnej MON. Ośrodek Szkolenia ACKS prowadzi kursy i szkolenia dla personelu polskiego i międzynarodowego w zakresie komunikacji strategicznej. Ponadto przygotowuje i organizuje konferencje naukowe i seminaria (m.in. na potrzeby MON). Współuczestniczy w planowaniu, przygotowaniu i realizacji ćwiczeń szczebla strategicznego i operacyjnego, a także współpracuje m.in.