Momenty wyodrębnienia się wspólnej linii rozwojowej D. paradiseus+D. annectens oraz moment rozejścia się linii tych dwóch gatunków wynosi odpowiednio: Pasquet et al. (2007): brak szczegółowych danych, te są dostępne jedynie dla kladu skupiającego 7 gatunków, w tym D. paradiseus i D. annectens Jetz et al. (2012): 11,7 mln i 2,38 mln lat temu Price et al. (2014): 8,2 mln i 5,6 mln lat temu Marki et al. (2015): 11,1 mln i 3,76 mln lat temu Jønsson et al. (2016): 8,8 mln i 1,96 mln lat temu
Podgatunki mały|Rysunek przedstawiający głowę dziwogona rajskiego IOC, Clements Checklist of Birds of the World i AviList wyróżniają 13 podgatunków dziwogona rajskiego: D. p. grandis (Gould, 1836) D. p. rangoonensis (Gould, 1836) D. p. paradiseus (Linnaeus, 1766) – podgatunek nominatywny D. p. johni E. Hartert, 1902 D. p. ceylonicus Vaurie, 1949 D. p. otiosus (Richmond, 1902) D. p. nicobariensis (Baker, 1918) D. p. hypoballus (Oberholser, 1926) D. p. platurus Vieillot, 1817 D. p. microlophus (Oberholser, 1917) D. p. brachyphorus (Bonaparte, 1850) D. p. banguey (Chasen & Kloss, 1929) D. p. formosus (Cabanis, 1851) Howard and Moore Complete Checklist of the Birds of the World (2014) oraz Kompletna lista ptaków świata za podgatunek dziwogona rajskiego uznają także dziwogona wstęgopiórego (D. p.