Por. dr Bieniek w trakcie przesłuchań na Szucha był poddawany okrutnym, wręcz nieludzkim torturom. Był m.in. wieszany za ręce związane z tyłu (tzw. „słupek”). Został rozstrzelany w ruinach getta 26 lipca 1944 razem z grupą kobiet i mężczyzn. Wśród nich byli: Małgorzata Fornalska, Paweł Finder i Izabela Łopuska, aresztowana razem z por. dr. Bieńkiem.
Rodzina Andrzej Bieniek był żonaty z Marią Miecznikowską (1906–2002) (wnuczką Aurelii Miecznikowskiej), z którą miał córkę Zdzisławę (1931–1944) (zginęła w czasie Powstania Warszawskiego) i syna Andrzeja Zbigniewa (1934–1978).
Ważniejsze publikacje Polska metoda księgowości oparta na ekonomicznym systemie Taylora, 1927 Temat dla przedsiębiorstwa bankowego, 1929, 1931, 1933 Szkolna kasa oszczędności w szkole handlowej, 1934 Rozbiory Polski w świetle prawa międzynarodowego, 1934 Kontrola sprzedaży detalicznej dla celów księgowości, 1934 Księgowość w przedsiębiorstwach przemysłowych, 1935 Wstąpię do Szkoły Handlowej, 1935, 1936, 1937 Zarys systematyki kosztów własnych, 1938 Zasady analizy bilansów, 1939 Chcę być kupcem, 1939 Organizacja rachunkowości w przedsiębiorstwach przemysłowych, 1939 Quelques remarques sur la théorie des prix de revient, 1939