Po zjednoczeniu Niemiec klub został w lipcu 1990 roku reorganizowany jako nowy podmiot prawny. Drużyna została włączona do południowego oddziału nowo utworzonej NOFV-Liga Nordost (D3), kończąc inauguracyjny sezon 1990/91 na trzecim miejscu. W marcu 1992 roku drużyna piłkarska oddzieliła się od reszty klubu i założyła SV Thale 04, aby upamiętnić klub o tej samej nazwie założony w 1904 roku. Jednak nowo utworzona drużyna w pierwszym sezonie zajęła ósme miejsce w grupie Mitte Oberliga Nordost (D3), a w następnym sezonie 1992/93 ostatnie 17.miejsce i dlatego została zdegradowana do Verbandsliga Sachsen-Anhalt (D4). W 1994 w związku z utworzeniem Regionalligen (D3), poziom ligi spadł na 5 stopień hierarchii. Po zakończeniu sezonu 1999/2000 klub spadł do Landesliga Sachsen-Anhalt (D6). Sezon później, 1 lipca 2001 roku, zakończyła się przygoda SpVgg Thale 04 jako niezależnego kręgu. Jednostka powróciła do bycia oddziałem SV Stahl Thale. Po spędzeniu sezonu 2002/03 w siódmej lidze Kreisliga Quedlinburg piłkarze awansowali z powrotem do Landesliga Sachsen-Anhalt w 2005 roku. Po zakończeniu sezonu 2010/11 klub spadł do Landesklasse Sachsen-Anhalt (D8). W 2013 roku zespół wrócił do Landesliga Sachsen-Anhalt na pięć sezonów, zanim ponownie został zdegradowany do Landesklasse Sachsen-Anhalt.