Pozycja systematyczna Chińscy naukowcy zbadali rRNA węgorza ryżowego. Okazuje się, że ryby z Chin, Ryukyu i Azji południowo-wschodniej różnią się zarówno pod względem kodu genetycznego, jak i zachowaniami rozrodczymi. Być może sam węgorz ryżowy dzieli się na trzy populacje lub trzy odrębne gatunki, a M. albus tworzy klad reprezentujący go, jak i te trzy niepewne taksonomicznie gatunki. Niektórzy sądzą inaczej – od tej ryby wywodzi się aż pięć linii ewolucyjnych (podczas badań nazwano je A, B, C, D, E). Linia „A” najprawdopodobniej pochodzi z Tajwanu, a do linii rozwojowej „C” należało większość osobników badanych, sądzi się, że ta linia jest najbardziej rozszerzona na swoim terenie występowania. Potwierdza to liczba haplotypów u badanych węgorzy ryżowych.
Co ciekawe niedawno odkryto pewien szczep (odmianę barwną) tej ryby. Ma on kolor żółtawy, a na jego ciele występują liczne ciemne cętki. Obecnie jest częściej hodowana przez hodowców, wyróżnia się na tle innych ryb swą płodnością.
Z badań regionu kontrolnego i chromosomów wynika, że gatunek ten oddzielił się od długonosowatych 49,9 mln lat temu, a geny na przestrzeni ewolucji jedynie lekko się zmieniły, aby dostosować się czynników środowiskowych, jakie panują na obszarze występowania ryby.