Część wschodnia (450 km² powierzchni wodnej i 9 km² lądu). Jest to Archipelag Rimskiego-Korsakowa (wyspy Bolszoj Pelis, Stienina, Matwiejewa, De-Liwrona, Gildebrandta, Durnowo i kilka mniejszych), Część południowa (150 km² powierzchni wodnej i 2 km² lądu). Wyspy Furugelma, Wiery, Kolumna Gielmiersiena i kilka mniejszych, Część zachodnia (30 km² powierzchni wodnej). Skały Siwuczi, zatoki Minonosok i Kreisierow, Część północna (2,16 km²). Fragment Wyspy Popowa. Znajduje się tu muzeum rezerwatu.
Klimat w rezerwacie jest monsunowy. Zimą wiatry północno-zachodnie i północne wieją od lądu do morza, przynosząc suche i zimne powietrze. Średnia temperatura w styczniu to –11 °C. Lata są ciepłe, z częstymi deszczami, burzami i mgłami. Średnia temperatura w sierpniu to +21 °C.
Flora i fauna wysp Na wyspach zarejestrowano łącznie 880 gatunków roślin. Są wśród nich takie rzadkie gatunki jak np.: lilia zwisła i lilia tygrysia, pogonia z gatunku Pogonia japonica, psianka z gatunku Solanum megacarpum, podejźrzon z gatunku Botrychium strictrosa, brzoza Schmidta, dąb zębaty, kostrzewa z gatunku Festuca vorobievii, trawa z gatunku Hierochloë helenae.