W marcu 2020 wraz z grupą rolników zablokował drogę wojewódzką nr 432 w Nochowie ze względu na leżące w tym miejscu od kilku dni zwłoki dzika, które mogły przyczynić się do rozprzestrzenienia ASF na trzodę chlewną. W 2021 Sąd Rejonowy w Śremie uniewinnił go z zarzutu blokowania ruchu drogowego. W maju 2022 wraz z innymi osobami wszedł do biura poselskiego Lecha Kołakowskiego, w związku z czym przedstawiono mu zarzuty zakłócania porządku w miejscu publicznym oraz zorganizowania zgromadzenia bez wymaganego zawiadomienia. W listopadzie tego samego roku Sąd Rejonowy w Łomży uniewinnił go od tych czynów. W kwietniu 2023 lubelski sąd umorzył postępowanie przeciwko Michałowi Kołodziejczakowi oraz innym działaczom Agrounii oskarżonym o naruszenie miru w Lubelskim Urzędzie Wojewódzkim w grudniu 2022 podczas protestu przeciwko importowi ukraińskiego zboża do Polski.
Swoimi działaniami w tym czasie zyskał pewną rozpoznawalność, media zaczęły go nazywać „nowym Lepperem”.
W styczniu 2022 działające na University of Toronto interdyscyplinarne laboratorium Citizen Lab poinformowało, że telefon komórkowy Michała Kołodziejczaka był inwigilowany przy użyciu oprogramowania szpiegowskiego Pegasus.