Prowadził orkiestry Zagrzebia podczas licznych tournées po Europie, Ameryce Północnej i na Dalekim Wschodzie. Był gościnnym dyrygentem wielu prestiżowych zagranicznych orkiestr symfonicznych w Luksemburgu, Tuluzie, Mediolanie, Frankfurcie, Bratysławie, Salzburgu, Budapeszcie, Bukareszcie i Tallinnie. Dyrygował także Royal London Philharmonic Orchestra, Rosyjską Narodową Orkiestrą Symfoniczną w Moskwie, Orkiestrą Filharmonii Nowosybirskiej, Pittsburgh Symphony Orchestra, Chicago Festival Orchestra, Tokyo Philharmonics, Tokyo Symphony Orchestra oraz Tokyo and Yokohama Operas.
Nagrywał dla Croatia Records, Cantus i Opus.
Najczęściej granymi i nagrywanymi utworami Dešpalja są passacaglia i fuga na fortepianie i smyczkach, preludia chóralne, wariacje.
Był członkiem międzynarodowych jury konkursów dyrygenckich w Zagrzebiu, Budapeszcie i Tokio.