Przez wiele lat lokalne podejrzenia pozostawały na Schlittenbauerze z powodu jego nietypowych wypowiedzi, które były postrzegane jako wskazujące na znajomość szczegółów, które znałby tylko zabójca. Według relacji zawartych w aktach sprawy, miejscowy nauczyciel Hans Yblagger odkrył, że Schlittenbauer odwiedził szczątki zburzonego Hinterkaifeck w 1925 roku. Schlittenbauer stwierdził, że próba pochowania szczątków rodziny w stodole przez sprawcę była uniemożliwiona przez zamarzniętą ziemię. Uznano to za dowód, że Schlittenbauer miał wiedzę na temat warunków gruntowych w czasie morderstw, chociaż będąc sąsiadem i znając lokalną ziemię, mógł się tego domyślić. Kolejną spekulacją było to, że Schlittenbauer zamordował rodzinę po tym, jak Viktoria zażądała wsparcia finansowego dla młodego Josefa. Przed swoją śmiercią w 1941 roku Schlittenbauer wygrał kilka cywilnych pozwów o zniesławienie przeciw osobom, które określiły go jako „mordercę z Hinterkaifeck”.