Przez większość czasu solnisko jest suchą, słoną pustynią, a wodę można znaleźć jedynie w licznych otaczających je źródłach.
Flora thumb|left|Słonolubne trawy na obrzeżu solniska Etosza thumb|left|Roślinność obrzeży solniska z palmami Hyphaene ventricosa Solnisko Etosza jest niemal pozbawione roślinności makrofitowej. W porze deszczowej pokrywa je warstwa sinic. Z nielicznych makrofitów dominującym gatunkiem jest słonolubna trawa Sporobolus salsus, która kolonizuje rozległe obszary solniska, stanowiąc w porze suchej źródło pożywienia dla stad dużych kopytnych roślinożerców. Obrzeża solniska porastają halofityczne trawy z gatunków Sporobolus spicatus i Odyssea paucinervis, które w procesie cyklicznej sukcesji zastępują się wzajemnie w miarę zalewania lub wysychania solniska. W słonawych, nisko położonych obszarach otaczających solnisko, a także na pagórkach występujących na jego powierzchni, powszechne są również krzewinki z gatunku Suaeda articulata. Innymi gatunkami zasiedlającymi solnisko są łobody z gatunku Atriplex vestita, trawy z gatunków Sporobolus tenellus i S.