ligi.

W sezonie 1959/60 zespół ponownie został mistrzem Slovenskiej zony (D2) i grał potem w eliminacjach do 2.saveznej ligi. NK Karlovac wygrał pierwszy mecz z wynikiem 2:0. W przededniu meczu rewanżowego w Mariborze większość zawodników i personelu "Karlovca" zachorowała na zatrucie pokarmowe w hotelu Maribor. Chociaż nie udowodniono żadnej winy, NK Branik został zdyskwalifikowany i rozwiązany 11 sierpnia 1960 roku decyzją Jugosłowiańskiego Związku Piłki Nożnej.

W grudniu 1960 roku powstało NK Maribor, do którego dołączyli najlepsi zawodnicy Branika i Železničara (który wówczas był liderem Slovenskiej zony) i zajął miejsce Železničara w lidze i ostatecznie został mistrzem.

W MŠD "Branik" powstał nowy klub piłkarski NK Branik, który od sezonu 1960/61 startował w lidze Mariborskog podsaveza. W sezonie 1964/65 zespół powrócił do Słoweńskiej ligi republikańskiej (D3), gdzie grał z przerwami do sezonu 1971/72, a klub został rozwiązany w połowie lat 70. XX wieku.

NK Maribor, który stał się wiodącym słoweńskim klubem, stał się częścią MŠD "Branik" w 1988 roku, do którego dołączył również NK Branik i przez pewien czas (do 1996) występował pod nazwą Maribor Branik oraz został oficjalnie zarejestrowany jako Nogometni klub "Maribor Branik".

Barwy klubowe, strój, herb, hymn