Po zastosowaniu tego rozwiązania liczba uczniów szkoły wzrosła. W związku z rozwojem miasta, podjęto decyzję o budowie nowego budynku szkolnego. 27 października 1986 roku odbyła się uroczystość wmurowania kamienia węgielnego pod nowy budynek szkolny przy ulicy Miłej 18 (obecnie Westfala 3). W budynek szkolny zainwestowała Grodziska Spółdzielnia Mieszkaniowa, a jego budowy podjęło się Mazowieckie Przedsiębiorstwo Budownictwa Uprzemysłowionego. Po 1989 mały|Grodziska Hala Sportowa (2007) W roku szkolnym 1990/1991 zajęcia w szkole prowadzone były w trzech lokalizacjach: w willi „Miluchna”, Szkole Podstawowej nr 4 oraz w salach katechetycznych w kościele Parafii Miłosierdzia Bożego. 4 grudnia 1990 roku odbyło się oficjalne otwarcie nowego budynku szkolnego, w którym uczestniczyli m.in. nowa dyrektorka szkoły Danuta Pokropek oraz ówczesny burmistrz miasta Euzebiusz Sowa. 8 października 1995 roku w 75. rocznicę powstania szkoły oraz 85. rocznicę śmierci Marii Konopnickiej, odsłonięto mobilną płaskorzeźbę pisarki. W 1997 roku ukończono budowę nowoczesnej Grodziskiej Hali Sportowej, która jest połączona ze szkołą. W tym samym roku powołano Zespół Szkolno-Przedszkolny nr 2, w skład którego weszły Szkoła Podstawowa nr 2 im. Marii Konopnickiej i Przedszkole nr 2 im. Stefka Burczymuchy. Pod koniec lat 90. XX w.