Słudzy Boży ks. Bolesław Bazewicz i ks. Jan Naumowicz 20 maja 1942 roku niemieckie i litewskie oddziały policji pod dowództwem mjr Jonasa Maciulevičiusa, aresztowały i rozstrzelały 26 Polaków z Nowych Święcian, w tym ówczesnego proboszcza parafii ks. Bolesława Bazewicza i prefekta gimnazjum w Nowych Święcianach ks. Jana Naumowicza. Do mordu doszło 2 km od miasta, przy drodze w kierunku Święcian. Po wkroczeniu do miasta Armii Czerwonej 8 czerwca 1944 roku szczątki księży ekshumowano i pochowano na miejskim cmentarzu (zobaczː Zbrodnia w Święcianach (1942)).
Dzięki staraniom proboszcza ks. Broniusa Laurinavičiusa (1913–1981) w latach 1956–1959 dokończono budowę kościoła parafialnego. W kwietniu 1957 roku polsko-litewska czteroosobowa delegacja parafian wraz z księdzem proboszczem pojechała do Moskwy, aby uzyskać zezwolenie na dokończenie budowy. 27 kwietnia 1957 roku zezwolenie wydała Rada Ministrów LSSR. Jest to jedyny kościół na Litwie, na którego budowę wydano pozwolenie w czasach sowieckich.
Parafia posiada kaplicę filialną św.