Jednak późniejsze prace wykazały, że liczba fundamentalna zależy od populacji. Na Dalekim Wschodzie wynosi ona 68, natomiast na Hokkaido 70. Na Dalekim Wschodzie kariotyp obejmuje ogólnie 13 par autosomów metacentrycznych bądź submetacentrycznych, którym towarzyszy 7 par akrocentrycznych. Na Hokkaido występuje jedna para więcej chromosomów metacentrycznych bądź submetacentrycznych, wobec czego liczba autosomów akrocentrycznych wynosi 6. Oba chromosomy płci prezentują się akrocentrycznie, jednak chromosom X jest znacznie większy od chromosomu Y. Genetyka gatunku nie odzwierciedla jego rozmieszczenia geograficznego.
Budowa Ryjówka pazurzasta należy do największych przedstawicielek swojego rodzaju. Głowa i tułów mają długość od 7 do 9,1 cm, a więc nieco większą niż u ryjówki szinto, ryjówki równozębnej czy ryjówki średniej. Długość ogona wynosi od 4 do 5,5 cm, podobnie jak u ryjówki szinto, długość ta stanowi ponad połowę długości głowy i tułowia. Tylna stopa mierzy od 1,2 do 1,4 cm, trochę więcej niż u ryjówki szinto, ale mniej niż u ryjówki równozębnej. Masa ciała osiąga od 6,9 do 15 g, a więc zwierzę jest cięższe od ryjówki szinto, ryjówki średniej, ale już nie równozębnej. Ciężarna ryjówka pazurzasta ważyć może nawet 17 g.