Po objęciu przez Mieczysława Broniszewskiego funkcji trenera w Górniku Zabrze w kwietniu 2000 roku, Małowiejski został jego asystentem. Po zakończeniu sezonu 1999/2000 rolę Małowiejskiego przejął Józef Dankowski. W październiku 2002 roku zastąpił Janusza Batugowskiego jako szkoleniowca piłkarzy KSZO Ostrowiec Świętokrzyski. Pod wodzą Małowiejskiego piłkarze KSZO rozegrali dwadzieścia meczów w I lidze, przegrywając siedemnaście z nich. Po sezonie ostrowiecki klub spadł z ligi, a Małowiejski pozostał bez pracy.
Od końca marca do końca czerwca 2004 roku był asystentem Franciszka Smudy w Widzewie Łódź. Pod koniec 2004 roku był kandydatem do objęcia funkcji szkoleniowca piłkarzy Radomiaka Radom, jednak ostatecznie nie został trenerem tego klubu. W sierpniu 2005 roku zastąpił Jana Żurka w funkcji trenera Podbeskidzia Bielsko-Biała. 24 kwietnia 2006 roku stracił posadę.
W sezonie 2006/2007 był trenerem Lecha II Poznań oraz koordynatorem ds. młodzieży w klubie. Od lipca do grudnia 2011 roku był koordynatorem grup młodzieżowych w Podbeskidziu Bielsko-Biała.
Przypisy
Kategoria:Polscy trenerzy piłkarscy Kategoria:Trenerzy piłkarzy Wisły Płock Kategoria:Trenerzy piłkarzy Polonii Warszawa Kategoria:Trenerzy piłkarzy KSZO Ostrowiec Świętokrzyski Kategoria:Trenerzy piłkarzy Podbeskidzia Bielsko-Biała Kategoria:Ludzie urodzeni w Żychlinie Kategoria:Urodzeni w 1952