1 listopada 1944 roku wypłynął z Takao w konwoju MOMA-06 do Manili. Po drodze konwój był atakowany przez amerykańskie okręty podwodne, jednakże „Tottori Maru” zdołał uniknąć zatopienia. 14 listopada, podczas postoju w Manili, został uszkodzony przez amerykańskie samoloty. Wybuchy bomb naruszyły kadłub i spowodowały śmierć jedenastu członków załogi. Po niezbędnych naprawach statek opuścił port 29 listopada, by po sześciu dniach zawinąć do portu Cap St. Jacques w Indochinach. Od stycznia do marca 1945 roku przechodził remont w Singapurze.
Zatopienie 30 kwietnia 1945 roku „Tottori Maru” wypłynął z Singapuru pod eskortą stawiacza min „Hatsutaka”. Zawinąwszy do Hà Tiên w Indochinach, pobrał ładunek 500 ton ryżu, po czym 13 maja wyruszył wraz z „Hatsutaką” w rejs powrotny do Singapuru. Rankiem następnego dnia w Zatoce Tajlandzkiej amerykański okręt podwodny USS „Cobia” przeprowadził nieudany atak na stawiacz min. Jeszcze tego samego dnia inny okręt podwodny, USS „Hammerhead”, zaatakował „Tottori Maru”. Japoński statek zdołał jednak wyminąć trzy wystrzelone weń torpedy.