Większość autorów umieszcza dzięcioła czerwonoczubego w rodzaju Dryocopus, np. autorzy Kompletnej listy ptaków świata czy Międzynarodowy Komitet Ornitologiczny (IOC). Natomiast Międzynarodowa Unia Ochrony Przyrody (IUCN) oraz autorzy listy ptaków świata opracowywanej we współpracy BirdLife International z autorami Handbook of the Birds of the World (6. wersja online: grudzień 2021) zaliczają dzięcioła czerwonoczubego do rodzaju Hylatomus. IOC wyróżnia pięć podgatunków D. lineatus: D. l. erythrops (Valenciennes, 1826) – dzięcioł czarnogrzbiety D. l. fuscipennis P.L. Sclater, 1860 – dzięcioł płowobrzuchy D. l. lineatus (Linnaeus, 1766) – dzięcioł czerwonoczuby D. l. scapularis (Vigors, 1829) D. l. similis (R. Lesson, 1847). Niektórzy autorzy uznają dzięcioła płowobrzuchego za osobny gatunek.
Etymologia Dryocopus: druokopos „dzięcioł”, od δρυς drus, δρυος druos „drzewo”; κοπος kopos „bicie”, od κοπτω koptō „uderzać”. lineatus: oznaczony liniami, paskowany.