W lutym 2016 została uhonorowana nagrodą im. św. Kamila za swoją działalność społeczną. W czerwcu tego samego roku odeszła z programu Świat się kręci, a we wrześniu rozpoczęła współpracę z grupą Discovery Networks, obejmując stanowisko dyrektorki rozwoju kanału TLC Polska. W październiku przekazała prawa do swojej witryny OnaOnaOna.com firmie Ringier Axel Springer Polska i zakończyła współpracę z redakcją „Skarb”. Wiosną 2017 zadebiutowała na antenie TLC z autorskim programem Zmiana pełną parą, poza tym wystąpiła w kampanii reklamowej marki odzieżowej Cacofonia Milano, a w maju premierę miała książka Moja wizja, będąca wywiadem–rzeką z Młynarską przeprowadzonym przez Agnieszkę Litorowicz-Siegert. Po przejęciu Grupy TVN przez Discovery prowadziła programy w stacjach należących do grupy TVN Discovery Polska: Eks-tra Zmiana w TVN Style (2018–2019), a także Bez tabu (2019) i Włącz zdrowie (2020) w Discovery Life oraz Kobiety bez tabu w TVN Style (2020). W 2019 była nominowana do Gwiazdy Plejady dla osobowości roku. W 2020 prowadziła internetowy format #agatasiekreci na swoich profilach w serwisach Instagram i YouTube. Jesienią 2021 powróciła w charakterze prezenterki programu Bez tabu, tym razem emitowanego w TVN Style, który prowadziła przez kolejne trzy sezony do jesieni 2022.