Kariera trenerska Brian Schmetzer jeszcze w trakcie kariery piłkarskiej był grającym asystentem trenera w występującym w lidze MISL Tacomie Stars. Po zakończeniu kariery piłkarskiej, w latach 1996–1997 był asystentem trenera Fernando Clavijo w nowo powstałym klubie, występującym w lidze CISL Seattle SeaDogsFive meetings that shaped newly-minted Sounders coach Brian Schmetzer’s career [data dostępu: 2016-11-04] , który w swoim ostatnim sezonie – sezonie 1997, zdobył mistrzostwo ligi CISL. Następnie trenował drużyny juniorskie FC Emerald City, a także wraz z Dickiem McCormickiem prowadził biznes budowlany.
USL Po sezonie 2001, klub ligi USL First Division Seattle Sounders zwolniło trenera Berniego Jamesa, który trenował klub od początku jego istnienia. Dyrektor generalny klubu, Adrian Hanauer, skontaktował się z Schmetzerem w sprawie przejęcia funkcji trenera klubu, następnie przeprowadził rozmowę kwalifikacyjną w jednej z kawiarni dzielnicy Seattle, Capitol Hill.