Doszło do bezpośredniego starcia, które pomimo dużego oporu Duńczyków zakończyło się zwycięstwem wojsk pruskich.
Obrońcy byli wspierani z morza przez okręt pancerny – monitor „Rolf Krake”.
Straty po bitwie W oficjalnych szczegółach armii duńskiej straty sięgają odpowiednio:
Po stronie duńskiej: ok. 700 zabitych, ok. 560 rannych, z czego wzięto do niewoli lub popełniło dezercję, ok. 3 500 żołnierzy, łącznie straty sięgnęły około 4 800 ludzi. Po stronie pruskiej: ok. 270 zabitych, ok. 900 rannych, zaginionych ok. 30 żołnierzy, łącznie straty sięgnęły około 1 200 ludzi
mały|Zniszczony wiatrak dzień po bitwie Bitwa pod Dybbøl była pierwszą bitwą, która była obserwowana przez delegatów Czerwonego Krzyża: Louisa Appię (1818-98) i Charlesa van de Velde (1818-98).
Konsekwencje Rozejm obowiązywał po bitwie od 12 maja do 26 czerwca, a w Londynie rozpoczęły się negocjacje w sprawie nowej granicy między Danią a Związkiem Niemieckim. Dania chciała granicy z rzeką Eider, ale zostało to odrzucone jako nie do zaakceptowania dla strony pruskiej. Nieugięta postawa duńskiego rządu w Londynie doprowadziła do ich dyplomatycznej izolacji podczas negocjacji w Wiedniu, co zaowocowało traktatem pokojowym podpisanym 30 października 1864 r.