Okres 1429–1530 W 1429 wyspy zostały zwrócone Alfonsowi V. To, czy wynik ten był pozytywny dla tubylców, jest dyskusyjne. W tym okresie wyspy borykały się z częstymi atakami korsarzy, chroniczną biedą i okresowymi klęskami głodu. Później tytuły i lenno markiza Malty nigdy nie zostały przekazane żadnemu władcy wysp.
Okres dominium Malty i Gozo dobiegł końca w 1530, kiedy Karol V, cesarz rzymski oddał wyspy joannitom. Zapoczątkowało to okres joannitów na Malcie (1530–1798). Przywódcy joannitów zgodzili się oddać hołd wicekrólowi Sycylii, ale nie otrzymali tytułu hrabiego ani markiza Malty, co zakończyło istnienie hrabstwa.
Hrabiowie Malty Margarytus z Brindisi (1192-1194) Guglielmo Grasso (ok. 1197-1203) Enrico "Pescatore" (ok. 1203-1232) Nicoloso (ok. 1232-1266) Karol I Andegaweński (bezpośrednie rządy 1266–1282), uzurpator podczas Nieszporów sycylijskich;