W 1465 roku miasto Nepomuk uzyskało przywilej corocznych czterodniowych targów. W 1512 roku miasto uzyskało prawo do drugiego jarmarku. Dbający o rozwój miasta właściciele zadbali również o nadanie mu prawa do warzenia piwa. Niestety, w późniejszych wiekach liczne konflikty zbrojne i klęski głodowe doprowadziły do podupadnięcia miasta. Podczas licznych pożarów w okresie między XVI i XIX wiekiem zostało zniszczone sporo okazałych historycznych budynków.
W 1961 roku miasto zostało powiększone o kilka wsi. W latach 80. w miejscu wyburzonych zabytkowych budynków wybudowano centrum handlowe.
Zabytki i atrakcje turystyczne Gotycki, trójnawowy kościół św. Jakuba zbudowany w latach 1290–1295 z grobowcem rodu Śwanberków i w 1780 roku dobudowaną barokową dzwonnicą. Arcydekanat z 1748 roku zbudowany według planów Kiliana Ignacego Dientzenhofera, przebudowany podczas II wojny światowej. Kościół św. Jana Nepomucena wybudowany w latach 1729–1736 z okazji kanonizacji tego świętego według planów Kiliana Ignacego Dientzenhofera na miejscu istniejącego tu przedtem kościoła św.