Kult Obraz Pana Jezusa od początku znajdował się w starym kościele Narodzenia NMP. W latach 1986–2003 wzniesiono nowy kościół (sanktuarium Pana Jezusa Przemienionego) i w tym samym czasie przeniesiono obraz do nowego kościoła, gdzie znajduje się w głównym ołtarzu. Wokół obrazu znajdują się kasety z wotami (niektóre mają ponad 200 lat). W każdy czwartek odbywa się nowenna do Przemienienia Pańskiego z odczytywaniem intencji składanych przez wiernych z tzw. mszą św. zbiorową, a w sierpniu odbywa się Tygodniowy Wielki Odpust (6 sierpnia – centralny dzień odpustu); zainaugurowany w roku 2003 (wcześniej jednodniowy poprzedzony Triduum). Istnieją specjalne modlitwy i pieśni do Krużlowskiego Chrystusa, m.in. ks. Wojciech Wojtoń TJ ułożył: „Krótkie trzydniowe nabożeństwo i nowennę do słynącego łaskami obrazu Przemienienia Pańskiego w kościele parafialnym w Krużlowej, w powiecie nowosądeckim”, wydane w formie broszurki w Nowym Sączu (w roku 1942). Na wieży nowego kościoła (sanktuarium) jeden z trzech dzwonów (największy) otrzymał imię: Przemiennie Pańskie (800 kg), odlany w 1997 r. u Janusza Felczyńskiego w Ostrowie.