W latach 2003–2006 uczestniczył w projekcie „Przemiany kulturowe i osadnicze nad dolną Regą w XII-XIV w.”. W 2003 został równocześnie zatrudniony na Uniwersytecie Szczecińskim, tam stworzył Katedrę (Zakład) Archeologii i kierował nią w latach 2005-2019Złota księga nauki polskiej w 100 rocznicę odzyskania niepodległości. Tom II. M-Ż, wyd. Mastermedia i Helion, Gliwice 2020, s. 342. W latach 2006–2011 był kierownikiem szczecińskiego Oddziału IAE PAN, w 2009 otrzymał tytuł profesora nauk humanistycznych. W latach 2012–2019 był kierownikiem Ośrodka Archeologii Średniowiecza Krajów Nadbałtyckich IAE PAN, w 2019 został dyrektorem IAE PAN. W latach 2013–2019 uczestniczył w projekcie Ujście Odry we wczesnym średniowieczu. Wolin i Lubin – edycja źródeł archeologicznych, w latach 2016–2020 w projekcie Madinat Ilbira – poprzednik Granady. Średniowieczne miasto Umajjadów i Mozarabów na półwyspie Pirenejskim.