Napełnianie zbiornika rozpoczęto po ukończeniu budowy zapory w 2002 r. W dniu 1 stycznia 2010 r. poziom wody w zbiorniku Alqueva wyniósł 150,17 m n.p.m., co odpowiada 91 procentom jego maksymalnej pojemności. 12 stycznia poziom wody osiągnął 152,0 m n.p.m., tj. jeden metr poniżej maksymalnego poziomu przewidzianego na wypadek powodzi, dla którego zbiornik jest przygotowany. Odpowiada to objętości zmagazynowanej wody wynoszącej 4 150 milionów m³.
Rekreacja Na jeziorze dozwolone jest pływanie łodziami motorowymi (prywatnymi; do 7 metrów długości i mocy silnika 150 KM) oraz żaglówkami (prywatnymi; do 7 metrów długości). Dozwolona są także pływanie, windsurfing i wędkarstwo. Jazda na skuterach wodnych i parasailing są zabronione.
Inne Aktualnie (2022 r.) na powierzchni zbiornika Alqueva powstaje największa pływająca farma fotowoltaiczna w Europie. Projekt jest częścią strategii dynamicznego odejścia od importowanego gazu i kolejnym krokiem w kierunku neutralności klimatycznej. Pływające panele mają produkować energię ok. 4 MW, wystarczającą do zasilania 1500 okolicznych gospodarstw domowych i być tańszą alternatywą dla urządzeń opartych na paliwach kopalnych.