Finanse i wyniki przewozowe Kapitał zakładowy spółki w dniu jej powołania 1 stycznia 2003 wynosił 210 mln zł, natomiast od 22 sierpnia 2012 jego wartość to 328 917 500,00 zł. Właścicielem 100% udziałów przedsiębiorstwa jest Miasto Stołeczne Warszawa.

Zysk netto przedsiębiorstwa w 2004 wyniósł nieco ponad 4 mln zł. Do 2006 malał on, a w 2007 ponownie osiągnął wartość sprzed 3 lat. W 2008 spółka odnotowała zysk wynoszący niespełna 14 mln zł, w następnym roku 5 mln zł, a w 2010 trzykrotność zysku z 2009. W 2011 Metro Warszawskie zarobiło 5,4 mln zł, a rok później 9,4 mln zł. W 2013 odnotowano rekordowy zysk wynoszący 70,9 mln zł, w 2014 wartość ta wyniosła nieco ponad 45 mln zł, w 2015 5,3 mln zł, w 2016 9,7 mln zł, w 2017 25,4 mln zł.

W 1995 warszawskie metro przewiozło 20 mln pasażerów. Od pierwszego roku eksploatacji do 2011 roczna liczba pasażerów z roku na rok rosła. W 2012 nastąpił niewielki spadek przewozów względem 2011, a w 2013 ponownie wzrost wynoszący 5,8% względem roku poprzedniego. Przewozy Metra Warszawskiego wynosiły w ostatnich latach 170 mln pasażerów rocznie i około 680 tys. dziennie w 2015, w 2016 183,7 miliona pasażerów rocznie.