Epidemiologia Patogen powodujący czarnego raka nie może bezpośrednio wniknąć do zdrowego drewna. Wrotami zakażeń są rany na gałęziach i pniach spowodowane gradobiciem, urazami zimowymi, urazami mechanicznymi, insektami lub innymi chorobami. Patogen może zimować w zrakowaceniach zarówno żywych, jak i martwych drzew, a także w zmumifikowanych owocach pozostawionych w jabłoniach z poprzedniego roku. Zimują jego pyknidia. Wiosną źródłem infekcji pierwotnych są wytwarzane w nich konidia. Konidia są także źródłem infekcji wtórnych w całym sezonie wegetacyjnym.
Ochrona Zmumifikowane owoce na drzewach powinny być usuwane, jeśli kiedykolwiek zostaną znalezione na drzewie, ale szczególnie podczas przycinania gałęzi w okresie uśpienia, kiedy można je łatwiej zobaczyć. Raki mogą być usuwane z drzew, jeśli jest to wykonalne i praktyczne. Przycinanie chorych i rakowatych kończyn oraz martwego drewna najlepiej jest wykonywać w okresie uśpienia. Ważne jest, aby usunąć zainfekowane gałęzie lub drewno z sadu, ponieważ czarna zgnilizna może przetrwać i wytwarzać zarodniki na martwym drewnie. Spalanie takiego drewna zmniejsza poziom inokulum.