Kolejnych 180 taksonów ma niepewne pochodzenie, podczas gdy co najmniej 640 taksonów uważa się za kenofity, ponieważ zostały wprowadzone po 1500 roku i mogą obejmować przypadkowe gatunki obce. Co najważniejsze, co najmniej 24 endemiczne rośliny naczyniowe i 18 roślin naczyniowych są subendemiczne dla regionu śródziemnomorskiego.
Endemiczne rośliny naczyniowe
+ObrazNazwa gatunkuframelessAllium lojaconoi (Maltański czosnek karłowaty)Allium melitenseframelessAnacamptis pyramidalis var. urvilleanaframelessAnthemis urvilleanaAnthyllis hermanniae subsp. melitensisAtriplex lanfrancoiframelessCheirolophus crassifoliusframelessChiliadenus bocconeiframelessEuphorbia melitensisframelessHelichrysum melitenseframelessHyoseris frutescensLegousia hybrida var. foliosaframelessLimonium melitenseLimonium zeraphaeMatthiola incana subsp. melitensisOphrys bombyliflora var. parvifloraOphrys hospitalisOphrys melitensisframelessOrobanche densifloraOrobanche mutelii var. melitensisRomulea melitensisSalsola melitensisSedum album subsp. rupi-melitenseZannichellia melitensis
Subendemiczne rośliny naczyniowe