Jeszcze w końcu 1842 otrzymał probostwo w parafii w Starym Targu, jednej z najbardziej polskich parafii w dekanacie sztumskim, gdzie posługiwał do 1846 rokuPastoralblatt für die Diöcese Ermland herausgegeben von Professor Dr. F. Hipler, Regens des Priestseminars zu Braunsberg, Nr. 7 Juli 1876, Dekanat Stuhm, s. 80Julian Wojtkowski Zasięg terytorialny języka polskiego w kazaniach na Warmii i Powiślu według akt wizytacyjnych diecezji warmińskiej z lat 1839-1858.
Jego zapał do zgłębiania wiedzy skłoniły go do przeniesienia się do dalszej posługi do Olsztyna. W 1847 czynił starania o uzyskaniu stanowiska profesora w Liceum Hosianum w Braniewie, jednak bezskutecznie. W 1851 spełniło się jego marzenie o sprawowaniu funkcji wykładowcy, gdy, po uzyskaniu habilitacji, został przyjęty jako docent na Wydział Teologiczny do Liceum Hosianum w Braniewie. Podejmował się z zapałem wykładania wielu różnych dyscyplin. Był cenzorem ksiąg kościelnych. Zapał i gorliwość pracy odbiły się wkrótce negatywnie na jego stanie zdrowia. Skutkiem tego po zakończeniu semestru letniego 1856 poprosił o przeniesienie w stan spoczynku. Udał się do domu emeryta w Krośnie. Żył bardzo skromnie, spożywał tylko jeden posiłek dziennie, nie pił kawy ani alkoholu.